隨著新農(nóng)村建設(shè)的完善，弊端日益明顯地暴露出來，已經(jīng)不適應(yīng)新農(nóng)村建設(shè)的要求，必須進(jìn)行改革，通過改革促進(jìn)發(fā)展。其具體措施如下：

　　1.加強(qiáng)創(chuàng)新發(fā)展

　　1.1保證水資源的有效配置和可持續(xù)利用原則。我國水資源貧乏，實(shí)現(xiàn)水資源的優(yōu)化配置，提高水資源利用效率是社會經(jīng)濟(jì)長期健康發(fā)展的基本條件。所以，我國農(nóng)村小型水利工程管理體制必須保證水資源的有效配置和可持續(xù)利用。

　　1.2社會效益與經(jīng)濟(jì)效益兼顧原則我國農(nóng)村小型水利工程是國民經(jīng)濟(jì)和社會發(fā)展的重要基礎(chǔ)，其管理體制必須保證公益性水利工程兼顧社會效益與經(jīng)濟(jì)效益。其管理體制一方面要追求工程社會效益的實(shí)現(xiàn)，保障社會、經(jīng)濟(jì)發(fā)展對防洪保障、水資源供給的需求，另一方面，又必須著眼于工程管理單位本身的良性運(yùn)行和可持續(xù)發(fā)展，在盈利性與公益性之間尋求平衡點(diǎn)。

　　1.3實(shí)現(xiàn)責(zé)任管理發(fā)展

　　新時期農(nóng)村積極實(shí)行小型水田水利工程的責(zé)任管理發(fā)展制度，保證各類水利工程的有效發(fā)展與管理，實(shí)現(xiàn)責(zé)任化管理細(xì)則，確保監(jiān)督檢查水利工程的管理可以維持農(nóng)村水利運(yùn)用的安全運(yùn)行與有效管理，確保水利工程的正常監(jiān)督，實(shí)現(xiàn)行政部門的政企分離經(jīng)營，而且要確保水利行政部門的職能，要實(shí)現(xiàn)責(zé)任管理發(fā)展能力，提高運(yùn)行和維護(hù)的能力，保證工程安全和發(fā)揮經(jīng)濟(jì)效益。投資運(yùn)行與企業(yè)管理的水利工程要防止出現(xiàn)安全事故，一旦出現(xiàn)事故要依法追究相關(guān)部門和水利管理單位以及當(dāng)?shù)卣�府的�?zé)任。

　　2.耗費(fèi)收費(fèi)與耗費(fèi)補(bǔ)償制度

　　政府投資主要用于關(guān)系國家安全和市場不能有效配置資源的經(jīng)濟(jì)和社會領(lǐng)域，包括加強(qiáng)公益性和公共基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè)，保護(hù)和改善生態(tài)環(huán)境，促進(jìn)欠發(fā)達(dá)地區(qū)的經(jīng)濟(jì)和社會發(fā)展，推進(jìn)科技進(jìn)步和高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)化。從農(nóng)村小型水利工程的作用、功能看，是典型的純公共服務(wù)產(chǎn)品，水利工程的管理、運(yùn)行費(fèi)用補(bǔ)償完全應(yīng)該由政府予以支付，政府應(yīng)該建立水利工程耗費(fèi)補(bǔ)償制度，保障純水利工程安全運(yùn)行。

　　3.積極推行管養(yǎng)分離

　　在對農(nóng)村小型水利工程科學(xué)定崗和核定管理人員編制基礎(chǔ)上，將水利工程維修養(yǎng)護(hù)業(yè)務(wù)和養(yǎng)護(hù)人員從投資運(yùn)行主體中剝離出來，獨(dú)立或聯(lián)合組建專業(yè)化的養(yǎng)護(hù)企業(yè)，以后逐漸通過招標(biāo)方式擇優(yōu)確定維修養(yǎng)護(hù)企業(yè)各級政府和水行政主管部門及有關(guān)部門應(yīng)當(dāng)努力創(chuàng)造條件，培育維修養(yǎng)護(hù)市場主體，規(guī)范維修養(yǎng)護(hù)市場環(huán)境。

　　4.全面加強(qiáng)在建農(nóng)村水利工程建設(shè)的監(jiān)管力度

　　在農(nóng)村水利工程的建設(shè)施工過程中，工作人員需要制定合理的規(guī)劃方案，在施工中，要嚴(yán)格按照設(shè)計方案進(jìn)行操作，同時，還要有一套完善的管理制度與監(jiān)管體系。這樣才能夠最大限度保障施工質(zhì)量，促進(jìn)農(nóng)業(yè)經(jīng)濟(jì)的發(fā)揮。

　　4.1管理機(jī)制的建立。在農(nóng)村小型水利工程的建設(shè)過程中，建立科學(xué)完善的管理體制，是非常重要的。它能夠保障工程的順利進(jìn)行與合理施工，也能夠是工程質(zhì)量得到最大限度的保障，并且，還能夠提高施工速度，規(guī)范施工行為，使其能夠合理有序進(jìn)行。

　　4.2嚴(yán)格設(shè)計資質(zhì)證制度和工程招投標(biāo)制度。要依據(jù)審批工程的規(guī)模，建立健全資質(zhì)認(rèn)證制度，確保聘請具有一定設(shè)計資質(zhì)的、從事相應(yīng)水利工程的設(shè)計單位設(shè)計，嚴(yán)禁無資質(zhì)的單位和個人通過不正當(dāng)渠道獲取從事水利工程設(shè)計的權(quán)力，設(shè)計圖紙必須加蓋資質(zhì)證章方能使用。

　　5.全面加強(qiáng)現(xiàn)有水利工程的使用管理和維護(hù)

　　5.1安全管理，安全管理的首要條件是加強(qiáng)《水法》宣傳，在防止水利工程受到洪水等自然災(zāi)害侵襲的同時，也要防止少部分惟利是圖者人為破壞。其次是工程建設(shè)沒有主次之分，每個環(huán)節(jié)都很重要，特別是工程配套設(shè)施的建設(shè)質(zhì)量一定要保證，如小型水庫的泄洪口等。

　　5.2內(nèi)業(yè)資料管理，關(guān)于工程管理的標(biāo)準(zhǔn)、規(guī)定、法律等資料必須齊全；設(shè)計圖紙及文件、施工記錄、檢測結(jié)果、竣工驗(yàn)收報告等應(yīng)立項建檔；工程建設(shè)中出現(xiàn)的問題及解決的結(jié)果以及工程管理的各項檢查記錄資料也應(yīng)當(dāng)妥善保存。